Tôi đang thực hiện Kneaddata và humann3 để xác định gen chức năng cho metagenome súng ngắn bằng cách sử dụng các lệnh:
nhàodữ liệu --input AST2R1.fastq --input AST2R1.fastq -db $/home/plankton/Kneadata_DIR --output /home/plankton/Metagenomics_AST_Thatha/CG_DN_935 --trimmomatic /home/plankton/anaconda3/share/trimmomatic-0.39-2 --chủ đề 4
humann --input /home/plankton/Metagenomics_AST_Thatha/CG_DN_935/AST2.1/AST2R1_kneaddata.fastq --output /home/plankton/Metagenomics_AST_Thatha/CG_DN_935/AST2.1/AST2_humann --nucleotide-database /home/plankton/INSTALL_LOCATION -- chủ đề 8
Trong cả hai trường hợp, hệ thống mất nhiều thời gian và bị treo.
Ngoài ra, Firefox đang gặp sự cố.
Cấu hình hệ thống Ubuntu 20.04.3 LTS
df -h
Kích thước hệ thống tập tin được sử dụng Sử dụng có sẵn% Được gắn trên udev
32G 0 32G 0%/dev tmpfs 6.3G 2.0M 6.3G 1%
/chạy /dev/sdb3 457G 283G 152G 66%
/ tmpfs 32G 112K 32G 1%
/dev/shm tmpfs 5,0M 4,0K 5,0M 1%
/chạy/khóa tmpfs 32G 0 32G 0%
/sys/fs/cgroup
Báo cáo tai nạn
ls -al /var/sụp đổ
tổng cộng 53288
drwxrwsrwt 2 gốc whoopsie 4096 ngày 20 tháng 1 16:48 .
drwxr-xr-x 14 gốc gốc 4096 ngày 19 tháng 8 16:17 ..
-rw-r----- 1 sinh vật phù du whoopsie 33984941 Ngày 19 tháng 1 17:51 _usr_bin_gnome-shell.1000.crash
-rw-rw-r-- 1 sinh vật phù du whoopsie 0 ngày 18 tháng 1 15:47 _usr_bin_gnome-shell.1000.upload
-rw------- 1 whoopsie whoopsie 37 ngày 18 tháng 1 15:47 _usr_bin_gnome-shell.1000.uploaded
-rw-r----- 1 sinh vật phù du whoopsie 10929583 Ngày 15 tháng 1 21:59 _usr_bin_nautilus.1000.crash
-rw-rw-r-- 1 sinh vật phù du whoopsie 0 ngày 15 tháng 1 21:59 _usr_bin_nautilus.1000.upload
-rw------- 1 whoopsie whoopsie 37 ngày 15 tháng 1 21:59 _usr_bin_nautilus.1000.uploaded
-rw-r----- 1 sinh vật phù du whoopsie 9621952 Ngày 20 tháng 1 16:48 _usr_lib_xorg_Xorg.1000.crash
-rw-r--r-- 1 sinh vật phù du whoopsie 0 ngày 20 tháng 1 16:48 _usr_lib_xorg_Xorg.1000.upload
-rw------- 1 whoopsie whoopsie 37 ngày 20 tháng 1 16:48 _usr_lib_xorg_Xorg.1000.uploaded
Vui lòng cung cấp giải pháp
Cảm ơn bạn
