Tôi đang cố gắng (cài đặt lại) R trong WSL Ubuntu của mình. tôi đã làm với
sudo apt cài đặt r-base-core
Nhưng sau đó, tôi đã cố gắng đổi sang R 4.0 với một số phiên bản nén. Cuối cùng, phiên bản R 3 cũ đã được gỡ cài đặt khỏi hệ thống của tôi và R 4 đang chạy.
Về cơ bản, tôi muốn làm việc với DESeq2 và cài đặt một số thư viện như apeglm.
Vì tôi gặp một số sự cố nên tôi đã xóa/xóa tất cả các thư mục bằng R, bao gồm cả những thư mục trong 'local/bin' và 'local/lib'.
Bây giờ, tôi đang thử lại từ đầu nhưng tôi có những điều sau:
[Trong]
sudo apt cài đặt r-base-core
[ngoài]
Đọc danh sách gói... Xong
Xây dựng cây phụ thuộc
Đang đọc thông tin trạng thái... Xong
Không thể cài đặt một số gói. Điều này có thể có nghĩa là bạn có
yêu cầu một tình huống không thể hoặc nếu bạn đang sử dụng không ổn định
phân phối mà một số gói bắt buộc chưa được tạo
hoặc đã được chuyển ra khỏi Incoming.
Thông tin sau đây có thể giúp giải quyết tình huống:
Các gói sau đây có các thuộc tính không được đáp ứng:
r-base-core : Phụ thuộc: zip nhưng không cài đặt được
Tùy thuộc: giải nén nhưng nó không thể cài đặt được
Phụ thuộc: libpcre2-8-0 (>= 10.31) nhưng không thể cài đặt
Khuyến nghị: r-recommended nhưng nó sẽ không được cài đặt
Đề xuất: r-base-dev nhưng nó sẽ không được cài đặt
Đề xuất: r-doc-html nhưng nó sẽ không được cài đặt
E: Không thể khắc phục sự cố, bạn đã giữ các gói hàng bị hỏng.
Nếu tôi cố cài đặt phụ thuộc, ví dụ: 'zip', tôi nhận được thông tin sau:
[Trong]
sudo apt-get cài đặt zip
[ngoài]
Đọc danh sách gói... Xong
Xây dựng cây phụ thuộc
Đang đọc thông tin trạng thái... Xong
Gói zip không khả dụng nhưng được tham chiếu bởi một gói khác.
Điều này có thể có nghĩa là gói bị thiếu, đã lỗi thời hoặc
chỉ có sẵn từ một nguồn khác
E: Gói 'zip' không có ứng cử viên cài đặt
=======
chỉnh sửa: Tôi đã trải qua điều này: https://cran.r-project.org/bin/linux/ubuntu/#install-r nhưng nó không hoạt động từ phần này trở đi:
apt install --no-install-recommends r-base
Đầu ra giống như trước đây, nói rằng tôi thiếu một số phụ thuộc...
chỉnh sửa 2: Tôi đã đăng câu hỏi này ban đầu tại StackOverflow nhưng một người dùng nâng cao đã nói với tôi rằng sẽ tốt hơn nếu đăng nó thực sự tại Askubfox, vì vậy, tôi ở đây.
=======
Tôi biết rằng tôi đã làm sai một số điều, nhưng tôi thực sự sẽ đánh giá cao nếu ai đó có thể giúp tôi tìm ra con đường nào đó ở đây. Tôi có thể cung cấp thêm thông tin/nhật ký nếu đúng như vậy. Cảm ơn trước!