'Lỗi phân đoạn (đổ lõi)'. Tôi nên làm gì để khắc phục lỗi này?

Muhriddin Mahkamov

16:18, 03/12/2022

Tôi sẽ thực hiện phân tích cấu trúc thứ cấp (của protein) bằng cách sử dụng mô-đun 'gmx do_dssp' (tôi sử dụng gói Gromacs). 'Lỗi phân đoạn' xảy ra sau khi tôi đưa ra dòng lệnh - gmx do_dssp -f native.xtc -s md.tpr -map và tôi không thể có được kết quả đầu ra rất quan trọng. Tôi nên làm gì để khắc phục lỗi này?

Phiên bản Ubuntu hiện tại của tôi là 20.04
Gromacs là gói được sử dụng để chạy mô phỏng động phân tử. Trong gói này, tất cả các dòng lệnh bắt đầu bằng gmx. trong này đây gmx do_dssp .... là một lệnh phải cung cấp cho tôi thông tin cần thiết.
Trước đây, lỗi như vậy không xảy ra với ubuntu 18.04.
Tất cả các lệnh ngoại trừ gmx do_dssp hoạt động tốt (Gromacs chưa được cài đặt bị hỏng). Đó là, vấn đề chỉ xảy ra với lệnh này.

0 + 5

systemd-coredump

N0rbert

16:41, 03/12/2022

Phiên bản Ubuntu của bạn là gì? `gmx` là gì? Làm thế nào bạn đã cài đặt nó và phiên bản nào?

Hồi đáp

Knud Larsen

18:13, 03/12/2022

Tham khảo câu hỏi: "Gói Gromacs" â `/usr/bin/gmx` https://packages.ubuntu.com/focal/amd64/gromacs/filelist

Hồi đáp

waltinator

21:21, 03/12/2022

"`Lỗi phân đoạn`" là cách nói của Unix/Linux về "Truy cập bộ nhớ bất hợp pháp". Chương trình của bạn đã cố truy cập vào một địa chỉ bộ nhớ ngoài giới hạn. Kinh nghiệm gợi ý vị trí `0x00`. Phần còn lại của thông báo "`(core dumped)`" là tin tốt! Một báo cáo dài, chi tiết đã được ghi vào một tệp trong thư mục `/var/crash/`. Đọc nó với `less` hoặc `more`. Bạn đang thiếu một thư viện? Điều đó có thể dẫn đến nhảy tới `0x00`. Hãy xem `ldd $(loại -p gmx)`.

Hồi đáp

waltinator

21:23, 03/12/2022

Vui lòng [chỉnh sửa] bài đăng của bạn để thêm thông tin mới, được định dạng đúng. Thông tin được thêm qua nhận xét rất khó để bạn định dạng, chúng tôi khó đọc và bị người đọc trong tương lai bỏ qua. Vui lòng nhấp vào [chỉnh sửa]Â và thêm thông tin quan trọng đó vào câu hỏi của bạn để tất cả thông tin chúng tôi cần đều có trong câu hỏi. Vui lòng không sử dụng Thêm Nhận xét, vì đó là liên kết của chúng tôi với bạn. Tất cả sự thật về hệ thống của bạn nên có trong Câu hỏi với[sửa]

Hồi đáp

heynnema

23:48, 03/12/2022

Truy cập https://www.memtest86.com/ và tải xuống/chạy `memtest` miễn phí của họ để kiểm tra trí nhớ của bạn. Hoàn thành ít nhất một lần tất cả các bài kiểm tra 4/4 để xác nhận trí nhớ tốt. Điều này có thể mất nhiều giờ để hoàn thành. Báo cáo lại. Bắt đầu nhận xét cho tôi bằng @heynnema nếu không tôi sẽ nhớ chúng.

Hồi đáp

Phan Văn Trường

Câu hỏi này là trong các ngôn ngữ khác:

EN: 'Segmentation fault (core dumped)'. What should I do to fix this error?

TH: 'ความผิดพลาดของการแบ่งส่วน (คอร์ดัมพ์)' ฉันควรทำอย่างไรเพื่อแก้ไขข้อผิดพลาดนี้

RO: 'Anomalie de segmentare (core-dumping)'. Ce ar trebui să fac pentru a remedia această eroare?

RU: «Ошибка сегментации (сброс ядра)». Что мне делать, чтобы исправить эту ошибку?

VI: 'Lỗi phân đoạn (đổ lõi)'. Tôi nên làm gì để khắc phục lỗi này?

Đăng câu trả lời

Hầu hết mọi người không hiểu rằng việc đặt nhiều câu hỏi sẽ mở ra cơ hội học hỏi và cải thiện mối quan hệ giữa các cá nhân. Ví dụ, trong các nghiên cứu của Alison, mặc dù mọi người có thể nhớ chính xác có bao nhiêu câu hỏi đã được đặt ra trong các cuộc trò chuyện của họ, nhưng họ không trực giác nhận ra mối liên hệ giữa câu hỏi và sự yêu thích. Qua bốn nghiên cứu, trong đó những người tham gia tự tham gia vào các cuộc trò chuyện hoặc đọc bản ghi lại các cuộc trò chuyện của người khác, mọi người có xu hướng không nhận ra rằng việc đặt câu hỏi sẽ ảnh hưởng—hoặc đã ảnh hưởng—mức độ thân thiện giữa những người đối thoại.